Projekte

What the Phage

Mit "What the Phage" entwickeln Wissenschaftler aus dem Forschungscampus einen skalierbaren und einfach zu bedienenden Workflow für die Phagenidentifikation und -analyse.

Derzeit an der Entwicklung beteiligt sind vier InfectoGostics-Partner:

Der Workflow kombiniert bislang 11 etablierte Phagen-Identifikations-Tools, um die Nutzung verschiedener Phagen-Identifikations- und Vorhersage-Methoden in einem Arbeitsablauf zu vereinen. Das Hauptaugenmerk liegt dabei auf Stabilität und einer effizienten Datenfilterung/-analyse für den Benutzer.

WtP ermöglicht es Phagen in "fasta"-Sequenzen zu identifizieren, z.B. in metagenomischen Datensätzen. Später soll noch eine Erkennung von Prophagen implementiert werden.

WtP ist unter einer GPL-3.0-Lizenz frei auf GitHub verfügbar: github.com/replikation/What_the_Phage